纯的二甲基亚砜-d6在核磁共振波谱法当中是不会显示任何峰而常用于核磁溶剂，然而商业市售的二甲基亚砜-d6通常不是100%纯度，因此在核磁共振氢谱中2.54ppm的区域可发现未氘代的二甲基亚砜的五重峰；核磁共振碳谱中40.45ppm中可发现有未氘代二甲基亚砜的峰。